食用菌发酵罐是食用菌液体菌种生产流程的主要设备，发酵罐为液体菌的生长提供均匀、恒定的营养条件，主要包括提高溶氧浓度，对培养基进行充分混匀。

    食用菌发酵罐通常对于淀粉质培养基地灭菌采用实罐灭菌较好，一般在升温前先通过搅拌混合均匀，并加入一定量的淀粉酶进行液化；有大颗粒存在时应先经过筛除去，再行灭菌；对于麸皮、黄豆饼一类的固形物含量较多的培养基，采用罐外预先配料，再转至发酵罐内进行实罐灭菌较为有效。

    食用菌发酵过程中，菌丝体相互纠结成球状，所以在食用菌液体菌种发酵生产流程上发酵罐需保持干净，清洁，没有污染物。发酵罐在发酵中、后期染菌或发酵前期轻微染菌而发现较晚时，可以加入适当地杀菌剂或抗生素以及正常的发酵液，以抑制杂菌的生长速度，也可采取降低培养温度、降低通风量、停止搅拌、少量补糖等其它措施，进行处理。

    食用菌发酵罐内的负压严禁在清除空罐和实际清除后的冷却过程中产生，以免对设备造成污染甚至损坏。在排空和实际排空时，必须将剩余的水排尽在发酵罐的护套内。否则，发酵罐内筒可能被压缩，造成设备损坏。此外，过多的冷凝水会导致培养基稀释，不能满足工艺要求。