自动接菌机食用菌种分为一级种(母种)、二级种(原种)、三级种(栽培种)。如果一级种和二级种数量较少，必须通过接种细菌来扩大细菌的复杂性。这种转移方法和方法称为接种细菌(种)。自动接种机菌丝体的载体是培养基，富含氧气。在转移细菌的过程中，需要人工创造一个相对较少的杂菌操作空间，以控制杂菌的污染。

现有的自动接种机菌种接种技术是通过创造无菌环境，其手段包括：接种箱接种是通过氯等药物熏蒸；甲醛。高锰酸钾按比例放置在一起，使空气强烈氧化。

热空气接种细菌，小型电加热器经药物熏蒸后在电加热出风口接种。制作净化车间，通过初始效果和高效过滤器过滤空气，达到净化目的。

手段1。手段2和手段4使用化学药物，对人体造成潜在伤害，手段4一般出风口狭窄，接种不方便，使用手段3创造无菌环境投资大，也需要及时清洁更换过滤器，如果湿或更换不及时净化车间成为污染源，因此需要操作方便。具有良好的杀菌效果。